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甲状腺紊乱通常是由自身免疫机制以及自身抗体的产生所引起的。甲状腺过氧化酶(TPO)是一种仅由甲状腺细胞表达的膜联血糖蛋白。此酶催化甲状腺球蛋白内酪氨酸残基上碘化物的氧化以合成T3与T4，而且它是最重要的甲状腺抗原之一。
POAb水平测定是检测自身免疫性甲状腺疾病的最为灵敏的测试方法。在桥本甲状腺炎患者中可观察到最高的TPOAb水平。在此疾病中，TPOAb的检出率大约为90%，证实该疾病的自身免疫性起源。这些自身性抗体通常也出现(60-80%)在格雷夫斯病期间。
TPO自身抗体的存在与组织学甲状腺炎之间有着通常的联系。然而考虑到甲状腺受TSH影响而具有的很大的再生能力，在甲状腺机能减退临床表现变得显著之前，慢性甲状腺疾病可能会存在数年。
TPOAb检测有助于诊断甲状腺自身免疫性紊乱，而且可以使医师能够鉴别甲状腺自身免疫性紊乱与非自身免疫性甲状腺肿或甲状腺机能减退。
TPOAb是查出自身免疫甲状腺疾病最敏感的试验。在桥本甲状腺炎继发甲减的过程中，TPOAb是典型地首先出现的异常。事实上，当用敏感的免疫分析测定TOPAb时，95%以上的患桥本甲状腺炎者中可检测到TPOAb。
这些方法也同样在大多数（85%）Graves病患者检测到TPOAb。在怀孕早期，查到TPOAb的患者是发生产后甲状腺炎的危险因子。唐氏综合征患者由于自身免疫甲状腺疾病，增加了甲状腺功能紊乱的风险，需要每年筛查TSH和TPOAb。
最近报道指出，妊娠期体内TSH升高和/或可检测到TPOAb的母亲，可能会损伤新生儿童的智商（IQ）。这个报道已促成建议，所有孕妇在妊娠前3个月都应该检测TSH和TPOAb水平。此外，TPOAb测定对于不孕症也可能有用，因为高TPOAb常与流产和体外受精受孕失败的高风险相联系。
建议TPOAb检测用于：1、诊断自身免疫甲状腺疾病2、自身免疫甲状腺疾病的危险因子3、在?-干扰素、IL-2或锂治疗期间，发生甲减的危险因子4、胺碘酮治疗时，甲状腺功能紊乱的危险因子5、唐氏综合征患者的甲减危险因子6、妊娠期间的甲状腺功能紊乱和产后甲状腺炎的危险因子7、流产和体外受精受孕失败的危险因子1、诊断自身免疫甲状腺疾病2、自身免疫甲状腺疾病的危险因子3、在?-干扰素、IL-2或锂治疗期间，发生甲减的危险因子4、胺碘酮治疗时，甲状腺功能紊乱的危险因子5、唐氏综合征患者的甲减危险因子6、妊娠期间的甲状腺功能紊乱和产后甲状腺炎的危险因子7、流产和体外受精受孕失败的危险因子
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